phylogenetic node | nod filogenetik | Bioinformatik | Tiada | Titik pencabangan yang mewakili hasil taabiran jujukan leluhur. Terdapat tiga jenis nod, iaitu nod dalaman, nod luaran dan nod punca. Nod dalaman ialah titik pencabangan untuk dua atau lebih cabang yang mewakili hasil taabiran jujukan leluhur. Nod ini juga merujuk kepada leluhur sama paling terkini (MRCA). Manakala nod luaran ialah titik terminal tunggal yang dikenali juga sebagai dedaun pepohon filogenetik. Nod punca pula ialah nod permulaan pada pepohon yang juga mewakili leluhur sama untuk nod dalaman. Lihat juga leluhur sama paling terkini (MRCA). |
root | nod punca | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Induk kepada semua nod dalam rajah pepohon filogenetik. Nod punca dikenali juga sebagai leluhur sama terawal. Lihat juga nod filogenetik. |
the most recent common ancestor (MRCA) | leluhur sama paling terkini (MRCA) | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Sekumpulan taksa (takson B dan C) yang berkongsi satu nod (leluhur) yang sama. Nod ini mewakili Leluhur Sama Paling Terkini (MRCA). Takson A ialah kumpulan luar. Lihat juga kelompok luar. |
multifurcation | berbilang cabangan | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Nod yang tidak terlerai semasa pemecahan leluhur dan menghasilkan beberapa cabang pada nod dalaman, dalam pembinaan semula pepohon filogenetik. Lihat juga filogeni terlerai. |
polytomy | politomi | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Merujuk kepada nod dalaman pepohon filogenetik yang mempunyai dua atau lebih cabang terbentuk daripada nod tunggal yang disebabkan data yang tidak tentu kesahihannya serta kekurangan maklumat. |
outgroup rooting | kelompok luar berpunca | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Kaedah pengiraan purata jarak antara dua nod luaran paling jauh bagi menentukan nod punca. |
outgroup | kelompok luar | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Cabang pepohon filogenetik atau kladistik dengan nod punca yang sama, tetapi mempunyai jarak hubungan masa lebih jauh dengan kelompok dalam. Contohnya, takson A ialah kelompok luar, manakala takson B, C dan D ialah kelompok dalam. Kelompok luar digunakan sebagai titik perbandingan untuk kelompok dalam dan dihubungkan dengan nod punca yang sama. Banding kelompok dalam. |
node | nod | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | - |
operational taxonomic unit (OTU) | unit operasi taksonomi (OTU) | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Nod luaran pada pepohon filogenetik. Jujukan DNA dan protein dalam famili yang sama digunakan sebagai unit operasi taksonomi untuk mengelompokkan organisma melalui proses penjanaan pepohon filogenetik. |
rooted phylogeny | filogeni berpunca | Bioinformatik | Bioinformatik Molekul | Pepohon filogeni yang mempunyai nod punca yang mewakili leluhur pada dedaun pepohon filogenetik. Filogeni berpunca terhasil daripada proses puncaan pepohon filogenetik. Lihat juga puncaan pepohon filogenetik. Banding filogeni tak berpunca. |